Zwei Jahre sind vergangen, seit Jason Bourne, ehemaliger Auftragskiller der CIA, nach seinem Gedächtnisverlust seine ehemaligen Auftraggeber abgeschüttelt hat und mit seiner großen Liebe Marie in Goa in Indien untergetaucht ist. Nach wie vor wird Jason von Albträumen und Gedächtnisblitzen aus seiner Vergangenheit geplagt; er sieht immer wieder eine Szene in einem Berliner Hotel, wo er und sein – mittlerweile von der CIA liquidierter – Boss am Schauplatz eines Mordes sind.

In den USA bereitet indessen CIA-Einsatzleiterin Pamela Landy eine neue Aktion in Berlin vor. Ein russischer Hinweisgeber soll gegen entsprechendes Honorar Beweise für die Veruntreuung von 20 Millionen Dollar durch einen CIA-Agenten zugunsten russischer Verbindungsleute übergeben. Doch die Übergabe endet vor den Augen der CIA-Observierungsgruppe mit der Ermordung der beteiligten Agenten durch einen unbekannten Killer, der am Tatort einen Fingerabdruck von Jason Bourne hinterlässt.

In Goa stellt Bourne fest, dass ihn jemand beschattet: Der Russe Kiril, der Killer von Berlin, ist hinter ihm her. Während einer Verfolgungsjagd erschießt Kiril versehentlich Marie, die Bourne am Steuer abgelöst hat. Ihr Auto stürzt von einer Brücke in einen Fluss und Jason kann gerade noch sein eigenes Leben retten und dabei Kiril im Glauben lassen, er sei ertrunken.

Auf der Suche nach dem unbekannten Täter hat sich Pam Landy inzwischen mit dem Leiter des „Treadstone“-Geheimprojekts aus dem ersten Teil, Ward Abbott, und der damaligen Agentenbetreuerin Nicolette Parsons in Verbindung gesetzt und kann über die streng geheimen Treadstone-Akten schließlich den Berlin-Tatort-Fingerabdruck Bourne zuordnen. Als dieser bei seiner Einreise nach Italien in Neapel erkannt und festgenommen wird, nimmt sie seine Spur auf. Bourne schlägt seine Wächter nieder und hört die Verbindung zwischen den Mobiltelefonen des örtlichen CIA-Agenten und Landy ab. So erfährt er von der Killeraktion in Berlin und dass Landy hinter ihm her ist. Er macht sich per Auto auf nach Berlin, dort kontaktiert Bourne Landy über deren Telefon und vereinbart ein Treffen mit Nicolette Parsons auf dem belebten Alexanderplatz. Hier kann er dem CIA-Observationsteam entkommen, nachdem er von Nicolette erfahren hat, dass der Hintergrund von Landys Berliner Aktion die Ermordung des russischen Politikers Vladimir Neski war, der der Veruntreuung der CIA-Gelder auf die Spur gekommen war.

Über Zeitungsberichte im Internet kommt er auf das Hotel Brecker, wo Neski ermordet wurde. Er mietet sich dort ein und sucht das Zimmer auf, das als Tatort genannt worden war. Dort kommt ihm wieder die Erinnerung: Er selbst hatte Vladimir Neski im geheimen Auftrag seines korrupten Vorgesetzten getötet, als Feuerprobe für den Einsatz als Killer. Die CIA hat mittlerweile Bourne über die Berliner Polizei zur Fahndung ausgeschrieben und Bourne kann ihr nach einer wilden Verfolgungsjagd nur mit Mühe entkommen. Er schleicht sich in das Hotelzimmer von Ward Abbott, der ihm von Nicolette als Vorgesetzter seines früheren Chefs Conklin genannt worden war, und hört, wie dieser seinen Kontaktmann in Russland auffordert, ihn ermorden zu lassen, weil er an der Neski-Sache dran ist. Er stellt ihn zur Rede und schneidet sein Geständnis mit, wonach mit der Ermordung von Neski die Aufdeckung der Verschiebung der CIA-Gelder verhindert werden sollte. Als Bourne Abbott sein Diktiergerät zeigt, ist diesem klar, dass der Mitschnitt sein Ende bedeutet, und er begeht kurz darauf in Gegenwart von Landy Selbstmord als sie ihn zur Rede stellen will. Landy erhält später die Kassette mit Abbotts Geständnis. Bournes Unschuld ist somit bewiesen.

Parallel dazu reist Bourne nach Moskau, um die Tochter Neskis zu suchen. Dort wird er von der russischen Polizei und Kiril gejagt. Kiril schießt ihn an, und es kommt zu einer wilden Autoverfolgungsjagd mit der Polizei und Kiril, der dabei zu Tode kommt. Landy lässt mittlerweile über die russischen Behörden die Kontaktleute von Abbott dingfest machen.

Nachdem er Kiril entkommen ist, sucht er das Apartment von Neskis Tochter auf und klärt sie über die Wahrheit der Umstände des Todes ihrer Eltern auf.

Einige Zeit später wird Pamela Landy in ihrem Büro in New York von Jason Bourne angerufen. Sie dankt ihm für das Band und teilt ihm mit, dass der Fall jetzt zu Ende sei, sowie seinen wahren Namen David Webb. Er lehnt daraufhin ein Angebot, mit Landy persönlich zu reden, mit einem Hinweis auf ihr müdes Aussehen ab und verschwindet, bevor sie feststellen kann, von wo aus er sie beobachtet hat.

Quelle: WikiPedia DE